De flesta arbetsgrupper och projekt kräver någon form av struktur. I projektrummet skapas det i form av mappar. Varje mapp kan innehålla alla fyra typerna av objekt, Notiser, Att Göra, Filer och Diskussioner. Därför kan mapparna vara ett sätt att gruppera underämnen, delprojekt, områden eller dokument samt kombinationer därav. Projektrummet stöder även undermappar i flera nivåer.
Det kan vara klokt att tänka igenom detta från början och lägga upp en mappstruktur. En fördel med det är att när objekt skapas så kan de direkt placeras i den mapp där de hör hemma. Såväl mappstruktur och objektens placering kan efterhand givetvis ändras.
